Feugiat nulla facilisis at vero eros et curt accumsan et iusto odio dignissim qui blandit praesent luptatum zzril.
+ (123) 1800-453-1546
info@example.com

Related Posts

Welcome to MedicalPress a Premium Medical Theme

Aktivita

Home  /  Aktivita

Subjekt/ prijímateľ pomoci - MEDIREX GROUP ACADEMY n.o.

Výskumná aktivita 1:

Nádory endometria – zber vzoriek, biobanking, základná charakteristika pacientov a vzoriek (histologická analýza, genetická analýza – analýza genómu, proteometická analýza); dysplastické zmeny kŕčku maternice – typizácia vírusov

Podaktivita 1: Nádory endometria – zber vzoriek, biobanking, základná charakteristika pacientov a vzoriek

Primárnym cieľom aktivity je nábor pacientov; klinické vyšetrenia; napĺňanie biobanky vzorkami pacientov a databázy k nim prislúchajúcimi klinickými údajmi. Za týmto účelom budú realizované 2 štúdie týkajúce sa pacientiek s nádorovými a nenádorovými chorobami endometria. Pacientky budú vyšetrené pred a po chirurgickom zákroku a následne observované po dobu 10 rokov. Sekundárnym cieľom aktivity je aj analýza základných histologických charakteristík nádorových a nenádorových zmien endometria, vrátane analýzy základných diagnostických a prognostických histologických markerov.

Podaktivita 2: Nádory endometria – analýza genómu

Cieľom tejto časti aktivity je získať, analyzovať a intepretovať celogenómové sekvencie pre probandov štúdie. Budeme zisťovať prítomnosť germinálnych patogénnych a potencionálne patogénnych variantov za účelom identifikácie príčiny pozorovaných patológií a zároveň potenciálnych nových biomarkerov pre tieto patológie. Sústredíme sa aj na zistenie celogenómových profilov cirkulujúcich voľných DNA v kontrolnej a pacientskej skupiny aj s nízkym podielom signálu patogénnych variantov.

Podaktivita 3: Nádory endometria – proteomická analýza

Cieľom aktivity je identifikácia bielkovín v cirkulujúcich mikrovezikulách, ktoré budú korelovať so skúmanou endometriálnou patológiou. Identifikované bielkoviny predstavujú potenciálne diagnostické biomarkery pre včasnú diagnostiku ochorenia.

Podaktivita 4: HPV Assay

Cieľom aktivity je podrobná analýza premorenosti populácie HPV s poznaním typu vírusu (zamerané na analýzu cca. 20-30 typov patogénnych HPV vírusov spôsobujúcich zmeny krčka maternice).

Podaktivita 5: Aplikácia biosenzorov využiteľných v diagnostike nádorových zmien maternice

Cieľom aktivity je výskum využívajúci biosenzory pri štúdiu intersticiálnych zmien v nádorovom tkanive.

Partner 1 - Centrum experimentálnej medicíny Slovenskej akadémie vied

Výskumná aktivita 4 – Nádory endometria – úloha NO v progresii chorobných zmien endometria (15% flexibilita)

Cieľom aktivity je posúdiť význam aktivácie NO syntáz a ďalších faktorov zasahujúcich do regulácie produkcie NO v súvislosti s nádorovou transformáciou endometria za účelom identifikácie potenciálnych prediktívnych a terapeutických cieľov. Cieľom bude preskúmať úlohu jednotlivých izoforiem NO syntázy, ale i Toll-like receptora, NF-kB a iných prozápalových faktorov v mechanizmoch rakoviny maternice a určiť ich vzťah k prooxidačným faktorom a k cievnym zmenám pri nádorovej transformácii.

Partner 2 – Chemický ústav Slovenskej akadémie vied

Výskumná aktivita 3 – Nádory endometria – glykomická analýza (15% flexibilita)

Cieľom aktivity je stanoviť glykoprofil extracelulárnych vezikúl u pacientiek s patologickými zmenami endometria (v rámci štúdií EP a EC, získané vo výskumnej aktivite 1) za účelom identifikácie potenciálnych diagnostických a/alebo prognostických glykobiomarkerov pomocou hmotnostnej spektrometrie a metódou lektínových mikropolí. Získané dáta budú spracované tak samostatne, ako aj poskytnuté pre širšiu inteligentnú bioinformatickú analýzu.

Partner 3 – MindIT, s.r.o.

Výskumná aktivita 5 – Priemyselný výskum v oblasti techník strojového učenia

Cieľom aktivity je výskum techník strojového učenia (Machine Learning, ďalej len “ML”) a hlbokého strojového učenia (Deep Learning, ďalej len “DL”) pri spracovaní biomedicínskych vysoko dimenzionálnych, multimodálnych údajov (integrujúcich výsledky genetických, proteomických, histologických a glykomických analýz) a vyhodnotenie ich účinnosti na základe publikovaných prác. Cieľom je taktiež výskum účinnosti ML a DL klasifikátorov pri klastrovaní a klasifikácii biomarkerov, strojové vyhľadávanie mutačných vzorov v expresiách génu, vyhodnocovanie génových korelácii, automatizovaný návrh bio markerov, vytvorenie algorimu na spracovanie a vyhodnocovanie ctDNA dát z liquid biopsy u pacientov z A2WP1 ako aj výskum moderných DL techník pre spracovanie a klasifikáciu medicínskych dát, vytvorenie obrazovného klasifikátora pre identifikáciu karcinómu endometria na báze hlbokého strojového učenia.

Partner 4 – Univerzita Komenského v Bratislave

Výskumná aktivita 2 – Nádory endometria – genetické analýzy na stanovenie mikrosatelitovej instability, expertné klinické hodnotenie

Podaktivita 1: Stanovenie mikrosatelitovej instability a identifikácia sporadických prípadov

Na úplnej vzorke pacientiek s endometriálnou patológiou a potvrdeným endometriálnym karcinómom bude vykonaná state-of-art genetická analýza mikrosatelitovej instability. Cieľom aktivity je v porovnaní s IHC presnejšie stanoviť mikrosatelitovo instabilné prípady a ďalšom kroku stanoviť sporadické a dedičné formy a takto identifikovať kandidátov pre komplexnú genomickú analýzu.

Podaktivita 2: Návrh a testovanie inovatívnej metódy stanovenia mikrosatelitovej instability (15% flexibilita)

Cieľom aktivity je identifikácia prípadov nádorov endometria spôsobených mikrosatelitnou instabilitou so súčasnou identifikáciou sporadických prípadov a hereditárne podmienených prípadov novými inovatívnymi metódami.